Kurze Zusammenfassung der Story: Nachdem smtliche Engel besiegt wurden, beginnt das Human Complementation Project von SEELE. Diese sehen nun keine Verwendung mehr fr Gendo Ikari und NERV, da diese sich offenbar gegen sie gewendet haben. Die logische Konsequenz: Sie wollen sie aus dem Weg rumen und NERV bernehmen. Die Attacke beginnt mit einem Hackerangriff auf Magi, der von den anderen Supercomputern (Magi 2, 3 usw.) aus verschiedensten Staaten durchgefhrt wird. Whrend Ritsuko aus dem Gefngnis geholt wird, um Magi vor der bernahme durch die Gegner zu bewahren, beginnt die zweite Welle der Attacke: Einheiten der Japan Strategic Self Defense Force (JSSDF) unternehmen einen gnadenlosen Sturmangriff auf die Geofront...

In einem brutalen Gemetzel wird das NERV-Personal, das nie fr den Kampf gegen Menschen ausgebildet wurde, von den Spezialeinheiten berrannt. Misato, Makoto, Maya und Shigeru halten nach wie vor tapfer die Stellung und versuchen, die Eindringlinge aufzuhalten, was jedoch nur kurzfristig gelingt. Bald wird klar, da die JSSDF Order hat, die EVA-Piloten zu tten, falls sie sie finden. Daraufhin ordnet Misato an, Asuka aus dem Krankenhaus, in dem sie noch immer im Koma liegt, in den Entry Plug von EVA 02 zu verfrachten und diesen auf dem Grund des Sees zu verstecken. Rei jedoch ist seltsamerweise unauffindbar, und Shinji verkriecht sich irgendwo im Hauptquartier, anstatt seinen Befehlen, zu EVA 01 zu kommen, Folge zu leisten.

Die Lage wird immer aussichtsloser. Schlielich dringen die Soldaten in die Kommandozentrale vor. Whrend die Operatoren mit dem Mut der Verzweiflung kmpfen, macht sich Misato auf, um Shinji zu finden. Sie kommt gerade noch rechtzeitig und kann ihn vor dem Tod bewahren, wird dabei jedoch schwer verletzt. Mit letzter Kraft zerrt sie Shinji in den Aufzug zum Cage von EVA 01 und befiehlt ihm, Shogoki zu besteigen und zu kmpfen. Kurz nachdem der vollkommen verzweifelte Shinji hinunter gefahren ist, verblutet sie...

Indessen macht sich Gendo daran, seine khnsten Trume wahr werden zu lassen: Er holt Rei, die reglos und splitterfasernackt vor dem Becken mit den zerstrten Klonen steht, und fhrt mit ihr hinunter ins Terminal Dogma, zu Lilith...

Asuka wird indessen von den Einheiten der JSSDF geortet. Sie versuchen, EVA 02 zu zerstren. Dabei schaukelt sich Asuka langsam aus ihrem Koma hoch. Ihr wird schlagartig klar, da das AT-Field, von ihrer Seele und der ihrer Mutter generiert, sie die ganze Zeit beschtzt hat. Die Augen von EVA 02 erglhen, und er taucht aus dem See auf. Mit gnadenloser, nie gekannter Hrte geht Asuka gegen die Armee vor. Sie hat bereits groe Zerstrung angerichtet, als SEELE die Letzte Waffe einsetzt: Die EVA Series (Einheiten 05-13). Diese geflgelten Ungeheuer werden ber dem Kampfgebiet abgeworfen und greifen EVA 02. Dieser hat inzwischen das Umbilikal-Kabel verloren und nur noch fr fnf Minuten Energie. Asuka kmpft wie ein Berserker, und es gelingt ihr, einen Groteil der Kreaturen zu vernichten, aber dann ist der Strom pltzlich alle, und die vermeintlich zerstrten EVAs stehen wieder auf und strzen sich auf Nigoki, der frmlich zerfleischt wird.

Unten im Terminal Dogma unternimmt Ritsuko, mit einer Pistole bewaffnet, den Versuch, Gendo aufzuhalten, wird jedoch von diesem erschossen. Er sieht sich endlich seinem langersehnten Ziel gegenber: Der Wiedervereinigung mit Yui!

Indessen kauert Shinji im Cage neben EVA 01 und ist nicht fhig, einen klaren Gedanken zu fassen. Obwohl er nicht kmpfen will, steigt er letztendlich doch in Shogoki ein, als dieser die Hand zu ihm ausstreckt... seine Mutter hat ihn gerufen. Daraufhin rast EVA 01 mit einem entsetzlichen Heulen aus dem Hauptquartier senkrecht in die Hhe. Seine Flgel erscheinen an seinem Rcken, und seine Augen beginnen zu glhen: Der einzige Klon von Lilith ist erwacht.

Danach beginnt der zweite Teil des Films, Episode 26: Rei und Gendo stehen sich vor Lilith gegenber. Reis AT-Field kann ihre Form nicht lnger erhalten; ihr linker Arm fllt einfach ab, als bestnde sie aus Wachs. Gendo versucht, mit Rei zu verschmelzen, indem er seinen Handschuh auszieht (Adam ist in seine Hand eingebettet - das wird nicht gezeigt, aber es ist tatschlich so!) und mit seiner Hand in Reis Krper eindringt, der weich wie Butter zu sein scheint. Pltzlich jedoch weist Rei ihn zurck: Sie scheint zu erkennen, da sie ihm nicht gehorchen mu. Ihr Arm regeneriert sich in Sekundenschnelle, und sie beginnt zu schweben, steigt zu Lilith auf und verschmilzt mit den Worten "Ich bin zu Hause" mit dem Ungeheuer...

Die NERV-Operatoren und Fuyutsuki, die den Kampf und die Vernichtung Asukas sowie den Aufstieg Shogokis verfolgt haben, stellen entsetzt fest, da sich direkt aus dem Terminal Dogma ein Engel erhebt. Da erscheint eine gewaltige Kreatur, eine weie Riesin mit der Gestalt von Rei, die sich langsam erhebt...

Shogoki wird indessen von der EVA Series hoch hinauf in den blutroten Himmel getragen. Shinji, der nach wie vor in dem EVA sitzt, ist bereits am Ende mit seinen Nerven... doch ein noch viel grerer Schock steht ihm bevor, als sich vor seinen Augen die gigantische Rei aus den Wolken erhebt... in Panik schreit er auf. Pltzlich hrt er die Stimme von Kaworu, und als er die Augen ffnet, sieht er, wie sich ein ebenso riesiger Kaworu aus Rei/Lilith herausformt. Glcklich darber, wenigstens ihn noch einmal wiederzusehen, schliet Shinji die Augen, und Rei blickt direkt in sein Herz, um herauszufinden, was er sich fr diese Welt wnscht... sie berlt ihm die Entscheidung ber den Lauf des Schicksals.

Es folgt ein langer Teil mit Rckblenden und diversen Szenen aus Shinjis Vergangenheit und seinem Unterbewutsein. Am Ende lt er seinem Ha auf Asuka freien Lauf, indem er diese am Hals packt und erwrgt. Rei liest aus seinem Herzen, da er sich eine tote, leere Welt wnscht, und genau diesen Wunsch erfllt sie ihm...

Das Verhngnis beginnt: Die EVA-Series formen um Shogoki herum die Systema Sephirotim. Sie erzeugen ein Anti-AT-Field. Die Lanze des Longinus lst sich von der Mondoberflche, in der sie gesteckt hatte, und rast zu EVA 01. Sie wickelt sich um ihn, und aus dem ganzen Gebilde entsteht der Baum des Lebens... Der Third Impact wird eingeleitet. Rei/Lilith erhebt sich hoch ber die Atmosphre der Erde hinaus bis ins Weltall. In ihren Hnden trgt sie die Geofront, die sich als Ei Liliths entpuppt. Hilflos mssen die verbleibenden NERV-Mitarbeiter und der traumatisierte Shinji mitansehen, wie die Zerstrung ausgelst wird. Die EVA-Series schweben um Rei herum, whrend Unmengen seelenloser Rei-Kopien die Welt berschwemmen. Jede davon wird fr je einem Menschen zu seinem geheimsten Wunschtraum, kurz bevor alles Leben zu seinem Ursprung zurckkehrt und zu LCL zerfliet...

Am Ende zerfllt auch die gigantische Rei, und ihr gewaltiger Kopf strzt auf die Erde nieder, die sich in eine weie Leere verwandelt.

Shinji trifft Rei an einem Ort wieder, an dem ein Meer von LCL liegt. Auch Kaworu ist dort. Es folgt ein langes Gesprch zwischen den beiden Engeln, die Shinji erklren, was hier vor sich geht - und da es seine Entscheidung war, die dies ausgelst hat. Am Ende trifft Shinji auch seine Mutter wieder, und auch sie steuert ihren Teil zu der Erklrung bei.

Alles kehrt ins Nichts zurck... auch die EVA-Series erlschen und treiben in die Tiefe des Alls hinaus. Nur der leere, trostlose Planet bleibt allein zurck. Inmitten dieser Leere liegt Shinji neben der toten Asuka. Er beugt sich ber sie und beginnt erneut, sie zu wrgen. Pltzlich bewegen sich ihre starren Augen, und man hrt ihre Stimme: "Ich fhle mich mies." Das ist das Ende von Evangelion...

Auch, wenn diese Zusammenfassung die tiefschrfende und auf ihre ganz eigene Art und Weise schockierende Handlung sowie die philosophischen Erkenntisse, die von Rei, Kaworu und den anderen nach dem Third Impact zum Besten gegeben werden, nicht wiedergibt, so ist das durchaus beabsichtigt. Denn dies hier ist kein Essay, sondern nur eine kurze Abhandlung. Die Interpretation und Bewertung dieses Films gehrt nicht hierher. Aber vielleicht ist ja jemand bereit, ein Essay darber zu verfassen...? Ich warte... *g*